隨著兒童醫院的落成，兒童急診從2003年8月搬至兒童醫院地下一樓，重新打造一個屬於兒童急診獨立看診的空間。希望能用溫馨的環境，以及醫護人員親切的態度，來減少兒童看診的恐懼。除了急診看診區外，另外有19床的急診留觀區（如有大量傷患時能無限擴床），來提供需要暫時留院治療或觀察的空間。除了一般的問診及身體評估外，兒童急診還能提供:
血液、尿液、以及糞便檢驗
超音波掃瞄
心電圖檢查
X光、電腦斷層、以及核磁共振檢查
輸液治療
急救處理（如抽搐、溺水、窒息…）
住院安排
本院兒童急診為彰化縣唯一的兒童急診專科醫師訓練醫院。為提供更優良的醫療照護服務及品質，本院自2008年1月起為全國首創唯一具有兒科專科醫師資格之主治醫師提供急診駐診服務。
本科特點:
1.24小時全年無休
2.有兒童看診的獨立空間
3.處理各式兒童內科急症
4.接受診所及地區醫院之轉診及後續處置
5.兒童加護病房為後送單位，以便能在第一時間處理危急病患
6.轉介至其他科的窗口（如眼科、耳鼻喉科、皮膚科、小兒外科…）
7.彰化地區唯一一家小兒急診次專科訓練醫院
8.全國第一家完全由主治醫師看診的醫學中心
診治項目:
1.一般兒童疾病
2.高燒處理
3.呼吸窘迫
4.急性腹痛
5.抽搐處理
6.集體食物中毒
7.誤食藥物及異物
8.兒童急救（如溺水、窒息…）
9.兒童虐待
服務內容：
1.24小時兒童急診門診服務
2.24小時兒科急重症病患處理
3.兒童急診留觀室
4.小兒大量傷患處理
