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5.
HPV DNA and genotyping改自檢,新增Gastrointestinal panel
 2019.10.08

檢驗醫學部通知

  檢字10835

  期:2019108

受文者:全體醫護人員

  旨:

(1)  2019109日起,HPV DNA and genotyping (人類乳突瘤病毒基因分型)由委託檢驗改為自檢,相關檢驗訊息如下說明。

(2)   2019109日起,新增Gastrointestinal panel (腸胃道病原體多標的核酸檢測),相關檢驗訊息如下說明。

  明:

(1)   HPV DNA and genotyping (人類乳突瘤病毒基因分型)檢驗訊息如下表

檢驗項目

HPV DNA and genotyping (人類乳突瘤病毒基因分型)

檢驗收費碼

FVPHPG

健保碼(點數)

12182C*2(2000)

是否接受代檢

是,代檢費用請洽轉介中心(聯絡電話:04-72385953171)

檢體需求

1

採檢須知

(1) 檢體/採檢容器:(16) Cervical discharge / (41) 細胞採檢刷及保存液

(2) 建議採檢量:無

(3) 採檢注意事項(病人準備)

(A)  檢體採檢前不可內診,以防潤滑劑滲入。

(B)  採檢體前24小時不可沖洗陰道,不可用陰道塞劑,不可性交。

(C)  月經期間、懷孕期間及產後3-4個月內,不宜採檢,最好在月經來十天後採樣。

2

檢體傳送要求

以人工傳送或氣送方式送檢

3

退件條件

(1) 符合一般退件條件,請參見【檢驗資訊查詢系統】<檢體採集原則>「一般退件條件」。

(2) 特殊退件條件:無

4

檢體儲存條件

(1) 傳送前儲存條件:於2-30可穩定14

(2) 檢體上機(檢驗)前儲存條件:

(A)  2-30可保存14

(B)  -10以下可保存90

(3) 檢驗後檢體儲存條件:保存於-80冰箱,至少2個月

5

追加(additional) /

複驗(repeat)條件

檢體保存條件符合追加檢驗條件

6

進一步檢驗(reflex additional examination)

7

受理時間

24小時

8

報告時效

7

9

檢驗方法

Real-time PCR

10

生物參考區間

(1) Other High Risk HPVNot detected

(2) HPV type16Not detected

(3) HPV type18Not detected

11

適應症

用以偵測臨床檢體中高風險人類乳突瘤病毒(HPV) DNA(包括14種基因亞型:1618313335394551525658596668)

12

臨床意義

人類乳突瘤病毒Human Papillomavirus (HPV)是小型、不具外套膜之雙股DNA病毒(8000個鹼基對),於鱗狀上皮細胞的細胞核複製,並引起高度增生損害。HPV感染在性傳染疾病中非常普遍,大多數HPV感染臨床結果為良性且能自發性清除。然而,持續的HPV感染會導致子宮頸癌的發生。已有超過100種不同的HPV基因型被鑑定出來,其中超過40種會感染黏膜及生殖器上皮細胞。感染生殖器的HPV基因型依照其致癌之潛力,一般分為高風險(HR)及低風險(LR)HR HPV基因型與侵略性的子宮頸癌或者其前兆(高度鱗狀內表皮損害或子宮頸的內上皮贅瘤或原位癌)有關,而LR HPV則引起良性的損害,且與子宮頸癌沒有關聯性。全世界大約有70%侵略性的子宮頸癌是由HPV 16HPV 18所引起。相較於其他HR HPV基因型,感染HPV 16HPV 18與更高風險的疾病發展有關聯性。

與鑑定子宮頸細胞學突變的篩選方法相比,分子檢驗的方法能特異性偵測子宮頸細胞中HR HPV DNA的存在,能潛在地增加子宮頸癌症篩檢項目的靈敏度和效益。且在治療後追蹤和監控疫苗效力方面,使用HPV DNA試驗可有效地將細胞學模稜兩可的病患做分類。

本檢驗使用體外定性檢測試劑,可放大並偵測由檢體保存液收集之子宮頸細胞中的HPV DNA14HPV基因型(HPV 1618313335394551525658596668)的偵測方法是透過一組混合引子(針對HPV保留區域之L1基因區段)和單股DNA探針,能區分HPV 16HPV 18和非HPV 16/18HPV基因型(其他HR HPV)

HPV陰性結果不代表不需進行陰道鏡檢查。陰性結果表示HPV DNA的濃度無法測得或是低於預期的閾值。陽性結果表示任一型高危險度HPV存在或多型同時存在,但是因為病人常同時感染低危險度的HPV,病人若有混合感染的情況這樣的結果是無法將低危險度的型別排除。此項檢測結果應該只能和病人臨床評估和病史取得的資訊一起解釋。

13

執行組別

微生物組(連絡電話:04-72385955939)

14

其他

檢驗報告備註

(1)   Method : Real-time PCR

(2)   Target gene : Conserved L1 region of HPV genome

(3)   HPV DNA and genotyping: Not detected: DNA was undetectable or below the pre-set threshold

(4)   Other High Risk types: HPV types 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66 and 68 DNA

 

 

 

(2)      Gastrointestinal panel (腸胃道病原體多標的核酸檢測),相關檢驗訊息如下表

檢驗項目

Gastrointestinal panel – Adult (腸胃道病原體多標的核酸檢測-成人適用)

Gastrointestinal panel – Child (腸胃道病原體多標的核酸檢測-兒童適用)

檢驗收費碼

FVPGIA (成人)

健保碼

(點數)

12182C*7+12183C (8200)

FVPGIC (兒童)

12182C*4+12183C*3 (7600)

是否接受代檢

是,代檢費用請洽轉介中心 (聯絡電話:04-72385953171)

檢體需求

1

採檢須知

(1)   檢體/採檢容器

(A)   總院:糞便 (stool) / #77立寶糞便採檢瓶

(B)   分院與代檢:糞便 (stool) / #79糞便採檢棒及保存液套組(請於採檢前跟檢驗醫學部索取專用採檢容器)

(2)   建議採檢量

(A)    固態糞便:約花生米大小

(B)    液態糞便:至少5 mL

(3)   採檢注意事項(病人準備):檢體採集方式請參閱檢驗資訊系統檢體採集標準作業程序,體系前處理流程參照其他欄位。

2

檢體傳送要求

(1)   採檢容器為立寶糞便採檢瓶者:室溫立即傳送,或冷藏24小時內傳送。

(2)   採檢容器為糞便採檢棒及保存液者:於室溫2天內或冷藏3天內傳送。

3

退件條件

(1)   符合一般退件條件,請參見【檢驗資訊查詢系統】<檢體採集原則>「一般退件條件」。

(2)   特殊退件條件:無

4

檢體儲存條件

(1)   傳送前儲存條件

(A)    檢容器為立寶糞便採檢瓶:室溫立即傳送,或冷藏24小時內傳送。

(B)    採檢容器為糞便採檢棒及保存液:於室溫2天內或冷藏3天內傳送。

(2)   檢體上機(檢驗)前儲存條件:將檢體轉移到糞便保存液後,室溫可保存2天,2-8可保存3天。

(3)   檢驗後檢體儲存條件:剩餘檢體保存於2-8,至少7天。

5

追加(additional) /

複驗(repeat)條件

檢體保存條件符合追加檢驗條件

6

進一步檢驗(further examination)

7

受理時間

24小時

8

報告時效

2 小時

9

檢驗方法

Nested multiplex PCR (巢式多重聚合?鏈反應)

10

生物參考區間

Not detected

11

適應症

協助診斷引起腸胃道疾病的特定微生物,但無法作為診斷與治療的唯一依據。陽性結果無法排除共同感染的可能性,可能同時感染了本項目檢測病原以外的其他病原。陰性結果也不排除腸胃道的感染,可能是受到本項目無法偵測的病原感染,或者是發炎的原因並非感染,例如:潰瘍性結腸炎、大腸激躁症或克隆氏症。

本檢驗利用巢式多重聚合?鏈反應檢測有腸胃道感染徵兆/或症狀的糞便檢體,可同時檢測鑑定多種細菌、寄生蟲和病毒,包括:

(1)   細菌

(A)   曲狀桿菌(空腸曲狀桿菌/大腸曲狀桿菌/烏普薩拉曲狀桿菌) (Campylobacter (C. jejuni/C. coli/C. upsaliensis))

(B)   困難梭狀芽孢桿菌(C. difficile)毒素A/B (Clostridium difficile (C. difficile) toxin A/B)

(C)   類志賀鄰單胞菌(Plesiomonas shigelloides)

(D)   沙門氏菌(Salmonella)

(E)    弧菌(腸炎弧菌/創傷弧菌/霍亂弧菌),包括專一辨識霍亂弧菌(Vibrio (V. parahaemolyticus/V. vulnificus/V. cholerae), including specific identification of Vibrio cholera)

(F)    小腸結腸耶氏菌(Yersinia enterocolitica)

(G)   腸聚集性大腸桿菌(EAEC)(Enteroaggregative Escherichia coli (EAEC))

(H)   腸致病性大腸桿菌(EPEC)(Enteropathogenic Escherichia coli(EPEC))

(I)    腸毒素產生性大腸桿菌(ETEC) lt/st (Enterotoxigenic Escherichia coli(ETEC) lt/st)

(J)    志賀毒性大腸桿菌(STEC) stx1/stx2 (包括專一辨識STEC中的大腸桿菌O157血清群) (Shiga-like toxin-producing Escherichia coli (STEC) stx1/stx2 (including specific identification of theE. coli O157 serogroup within STEC))

(K)   志賀氏桿菌/腸侵襲性大腸桿菌(EIEC) (Shigella/ Enteroinvasive Escherichia coli(EIEC))

(2)   寄生蟲

(A)   隱孢子蟲(Cryptosporidium)

(B)   卡耶坦環孢子蟲(Cyclospora cayetanensis)

(C)   痢疾阿米巴(Entamoeba histolytica)

(D)   梨形鞭毛蟲(亦稱為腸賈第鞭毛蟲以及十二指腸賈第鞭毛蟲) (Giardia lamblia (also known as G. intestinalis and G. duodenalis))

(3)   病毒

(A)   腺病毒F 40/41 (Adenovirus F 40/41)

(B)   星狀病毒(Astrovirus)

(C)   諾羅病毒GI/GII (Norovirus GI/GII)

(D)   輪狀病毒A (Rotavirus A)

(E)    沙波病毒(基因群IIIIVV) (Sapovirus (Genogroups I, II, IV, and V))

12

臨床意義

(1)   隨著食物安全、公共衛生和醫療的進步,感染性腸胃炎仍是工業化國家所有年齡層人口的重大問題。在全球各地,感染性腹瀉疾病對於5歲以下兒童有明顯的發病率和死亡率,兒童腹瀉也可能導致營養失調、增加其他感染的易感性,以及可能造成生長及智力發展遲緩。

(2)   並非表現型認定為EAEC的所有菌株都具有pAA質體,也不是所有pAA質體都帶有aggRattR基因,因此檢驗方法無法完全檢測出所有EAEC,但可偵測出大多數的致病性菌株(含造成歐洲大流行的E.coli O104:H4)

(3)   STEC stx1/stx2EIEC為陽性結果時,表示檢體中可能含有Shigella dysenteriae

13

執行組別

微生物組(連絡電話:04-72385955936)

14

其他

檢驗報告備註

(1)   MethodNested multiplex PCR

(2)   Limit of detection

(A)    Campylobacter spp.4×104 cells/mL

(B)    Clostridium difficile toxin A/B4×105 cells/mL

(C)    Plesiomonas shigelloides1×103 CFU/mL

(D)    Salmonella spp.1×104 CFU/mL

(E)    Vibrio spp.8×104 cells/mL

(F)     Yersinia enterocolitica5×104 CFU/mL

(G)    Enteroaggregative Escherichia coli (EAEC)1×104 CFU/mL

(H)    Enteropathogenic Escherichia coli(EPEC)1×103 CFU/mL

(I)      Enterotoxigenic Escherichia coli(ETEC)1×103 CFU/mL

(J)      Shiga-like toxin-producing Escherichia coli (STEC) stx1/stx21×104 CFU/mL

(K)    Shigella/ Enteroinvasive Escherichia coli(EIEC)5×103 CFU/mL

(L)    Cryptosporidium5 x 103 oocysts/mL

(M)   Cyclospora cayetanensis180 genome equivalents

(GE)/mL

(N)    Entamoeba histolytica2 x 103 cells/mL

(O)    Giardia lamblia50 cells/mL

(P)     Adenovirus F 40/41100 TCID50/mL

(Q)    Astrovirus50 FFU/mL

(R)    Norovirus GI/GII1 x 104 RNA copies/mL

(S)     Rotavirus A1 x 105 FFU/mL

(T)    Sapovirus (Group)1.1 x 107 RNA copies/mL

(3)      相關問題,請聯絡檢驗醫學部主任醫檢師郭夙峰,分機5940

 

檢驗醫學部主任 林正修



 
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