兒童急診科具備獨立的兒童看診及留院觀察空間，並有專屬於兒童的醫護照護團隊，以提供24小時全年無休的兒童急診服務。診治項目除一般常見兒童疾病外，更致力於兒童急重症病患處理及兒童虐待…等。本科由臨床經驗豐富的兒童急診主治醫師，運用腹部超音波檢查，即時診斷腸套疊等急性腹部疾病，大幅減少腸套疊併發症，並且降低接受外科手術的風險。此外，為服務區域內急重難症兒童，特別與區域醫療院所共同建置即時通訊群組，提供快速且有效的雙向溝通與服務。本院兒童急診科是中彰投地區少數的小兒急診專科醫師訓練醫院之一，科內除著重醫護團隊高擬真模擬教學訓練課程，醫師更定期參與國內及國外期刊論文發表，致力於培養兒童緊急醫療的專業人才及提升醫學研究能力。
